Senior bioinformatiker till GMCK
Healthcare & Life Sciences · BioTech & Pharmaceuticals · Clinical Research · Bioinformatics
In short
Vi söker en erfaren bioinformatiker till Karolinska Universitetssjukhuset i Solna för att stärka arbetet med implementering av storskalig DNA-sekvensering inom sjukvården. Rollen innebär dataanalys av patientprover, utveckling av bioinformatiska flöden och samarbete i ett multidisciplinärt team.
Responsibilities
- Bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av bioinformatiska NGS flöden.
- Analysera patientprover inom interna och externa forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt.
- Bidra med expertis inom dataanalys i bioinformatiska utvecklingsprojekt.
- Bistå våtlabbsenheten med expertis inom dataanalys vid implementering av nya tekniker och metoder.
- Delta i teamets dagliga arbete samt bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.
- Delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS).
Requirements
- Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område.
- Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplat till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
- Goda programmeringskunskaper (t.ex. Python, R).
- Vana att arbeta i Linuxmiljö.
- Erfarenhet av arbete i HPC-miljö, gärna med SLURM.
- Goda kunskaper inom statistik, analys och testdesign.
- Mycket god förmåga att uttrycka sig på engelska, både muntligt och skriftligt.
Desired Qualifications
- Doktorsexamen (PhD) inom relevant område.
- Erfarenhet av arbete i klinisk sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, eller inom annan ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189).
- Erfarenhet av containerteknologier (t.ex. Singularity, Docker).
- Erfarenhet av automatiserad testning, CI och strukturerad kod.
- Kunskap i versionshantering (Git).
- Erfarenhet inom utveckling av bioinformatiska analyser med Nextflow eller liknande ramverk för automatisering av beräkningsanalyser.
- Erfarenhet av utveckling och arbete i kvalitetssäkrade miljöer.
- God förståelse för human genomik kopplat till sällsynta diagnoser eller somatiska sjukdomar.
- Fördjupade kunskaper inom design och validering av breda genetiska paneler.
- Goda kunskaper i svenska i tal och skrift.
Benefits
- En spännande multidisciplinär arbetsmiljö där ditt dagliga arbete gör stor skillnad för ett stort antal patienter.
- Stor möjlighet att utvecklas i din roll och ta dig an nya arbetsuppgifter över tid.
- Möjligheten att arbeta på ett av världens bästa sjukhus med vård i framkant (World's Best Hospitals 2026 - Newsweek Rankings).
- Generella förmåner som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder.
Skills
PythonRLinuxSLURMSingularityDockerGitNextflow
#bioinformatik#NGS#DNA-sekvensering#RNA-sekvensering#precisionsdiagnostik#genomik#klinisk relevans#teknisk spetskompetens#datanalys#HPC
About Region Stockholm
Är du beredd att tänka nytt och hitta framtidens lösningar? För vårt framtida uppdrag behöver vi medarbetare med hög kompetens, stort engagemang och som strävar efter ständig förbättring. Vid din sida kan du få engagerade kollegor inom hundratals kvalificerade yrken – ekonomer, sjuksköterskor, jurister, radiologer, ingenjörer och kirurger. Stockholms läns landsting är en av landets största arbetsgivare med ett livsviktigt uppdrag. Vi ger två miljoner invånare en effektiv kollektivtrafik och en god hälso- och sjukvård i landets snabbast växande region. Varje dag, dygnet runt.
Company
Region StockholmJob Posted
4 days ago
Expires
in 2 weeks
Employment Type
Full Time
Work mode
On Site
Hours per week
100
Experience Level
Senior
Locations
Solna, Sweden
Qualification
Master, Doctoral
Applicants
Be an early applicant
Similar Jobs
Ericsson
Linköping, SwedenMaster Thesis: Cloud-Native Lab Building Blocks
Internship Be an early applicant Posted 5 days ago
Ericsson
Stockholm, Sweden +1 moreSenior AI Researcher
Full Time Be an early applicant Posted 5 days ago
Ericsson
Stockholm, SwedenStorage DevSecOps Engineer
Full Time Be an early applicant Posted 5 days ago
Ericsson
Stockholm, SwedenNW Infra DevSecOps Engineer
Full Time Be an early applicant Posted 5 days ago
Ericsson
Linköping, SwedenMaster Thesis: Discovering Building Blocks in Test Environments
Internship Be an early applicant Posted 5 days ago
Ericsson
Stockholm, Sweden +1 moreAI Researcher
Full Time Be an early applicant Posted 5 days ago