Bioinformatiker
Healthcare & Life Sciences · BioTech & Pharmaceuticals · Bioinformatics
In short
Responsibilities
- Ansvara för leveranser av NGS analyser till användare.
- Hantera förfrågningar från användare och felsökning av bioinformatiska flöden.
- Bidra till kontinuerlig förbättring, validering och utveckling av bioinformatiska NGS flöden.
- Analysera patientprover inom externa forskningsprojekt och kliniska implementationsprojekt.
- Delta i teamets dagliga arbete och bidra till ett väl fungerande arbetsflöde.
- Delta i tvärvetenskapliga möten och samarbeten, exempelvis inom Genomic Medicine Sweden (GMS).
Requirements
- Magister- eller civilingenjörsexamen inom bioinformatik, bioteknik, biomedicin eller annat relevant område.
- Dokumenterad erfarenhet av bioinformatisk dataanalys kopplad till storskalig DNA/RNA-sekvensering (NGS).
- Goda programmeringskunskaper (t.ex. Python, R).
- Vana att arbeta i Linux-miljö.
- Erfarenhet av arbete i HPC-miljö, gärna med SLURM.
- Kunskap i versionshantering (Git).
- Kunskaper i Nextflow eller liknande ramverk för automatisering av beräkningsanalyser.
- Mycket god förmåga att uttrycka sig på engelska, både muntligt och skriftligt.
Desired Qualifications
- Erfarenhet av arbete i klinisk sjukhusmiljö, nära genetik eller patologi, inom ackrediterad verksamhet (t.ex. ISO 15189).
- Erfarenhet av automatiserad testning, CI och strukturerad kod.
- Erfarenhet av containerteknologier (t.ex. Singularity, Docker).
- Erfarenhet av utveckling och arbete i kvalitetssäkrade miljöer.
- Fördjupade kunskaper inom human genomik, speciellt kopplat till RNA- och metyleringsanalys med tillämpningar inom sällsynta diagnoser.
- Kunskaper inom hälsoinformatik och standardiserade datamodeller (t.ex HL7 FHIR och OMOP).
- Goda kunskaper inom statistisk analys och test design.
- God förmåga att uttrycka sig på svenska, både muntligt och skriftligt.
Benefits
- En spännande multidisciplinär arbetsmiljö där ditt dagliga arbete gör stor skillnad för ett stort antal patienter.
- Stor möjlighet att utvecklas i din roll och ta dig an nya arbetsuppgifter över tid.
- Möjligheten att arbeta på ett av världens bästa sjukhus med vård i framkant.
- Generella förmåner som Karolinska Universitetssjukhuset erbjuder.
Skills
About Region Stockholm
Är du beredd att tänka nytt och hitta framtidens lösningar? För vårt framtida uppdrag behöver vi medarbetare med hög kompetens, stort engagemang och som strävar efter ständig förbättring. Vid din sida kan du få engagerade kollegor inom hundratals kvalificerade yrken – ekonomer, sjuksköterskor, jurister, radiologer, ingenjörer och kirurger. Stockholms läns landsting är en av landets största arbetsgivare med ett livsviktigt uppdrag. Vi ger två miljoner invånare en effektiv kollektivtrafik och en god hälso- och sjukvård i landets snabbast växande region. Varje dag, dygnet runt.
Company
Region StockholmJob Posted
4 days ago
Expires
in 1 week
Employment Type
Full Time
Work mode
On Site
Salary
Negotiable
Hours per week
100
Experience Level
Mid-Senior
Locations
Solna, Sweden
Qualification
Applicants
Be an early applicant